Военный институт физической культуры - одно из немногих военно-учебных заведений России, которое в последние годы последовательно наращивало свой научный потенциал. В течение 1995-2008 гг. докторские диссертации защитило 24 научных сотрудника и преподавателя института. В этот же период кандидатами наук стали 103 человека. Ученое звание «профессор» присвоено 28 сотрудникам, «доцент» - 36. За каждой из этих цифр стоит многолетний, самоотверженный труд.Сегодняшние достижения научной школы института являются плодом коллективных усилий нескольких поколений ученых, в числе которых такие деятели, как В.К. Стасенков, К. Грантынь, В.В Гориневский, П.А. Рудик, А.В.Коробков, В М.Выдрин, Н.В. Зимкин, А.И. Яроцкий, Я.А.Канторович,Я.А. Эголинский, Ф.В. Судзиловский, Т.Т. Джамгаров, Л.А. Вейднер-Дубровин, С.М Ашкинази, А.А.Горелов, Ю.К. Демьяненко, Р.М.Кадыров, В.Л. Маришук, В.В.Миронов, В.П.Сорокин, В.А. Шейченко, В.А.Щеголев, В.И. Силин, В.Л Пашута, Н.В Романенко.
Ученые института принимают участие практически во всех международных конференциях, посвященных физической культуре. Институт как единственное военно-учебное заведение страны, готовящее кадры военно-физкультурного профиля, вносит определяющий вклад в развитие концептуальных положений физической подготовки и армейского спорта в Вооруженных Силах Российской Федерации. Особым смыслом наполнена эта работа в период формирования нового облика армии и флота России. В настоящее время усилия Научно-исследовательского центра, ведущих ученых направлены на создание пакета руководящих документов, регламентирующих физическую подготовку и спорт в войсках и вузах.
Ученые института вносят значительный вклад в разработку теоретических проблем физической подготовки войск. Так ими были подготовлены и апробированы Наставления по физической подготовке НФП-48,НФП-54, НФП-59, НФП-66, НФП-78, НФП-87 и НФПиС-2000,. Они активно участвуют в научной кооперации с коллегами из гражданских академий, университетов, научных учреждений и центров страны и города. В настоящее время завершается работа над Наставлением по физической подготовке 2009 года
Значительные результаты достигнуты в рамках выполнения заказных и инициативных тем научно-исследовательской работы по обоснованию теоретико-методических и нормативных основ физической подготовки военнослужащих женщин, воспитанников суворовских, нахимовского училищ и кадетских корпусов - динамическому изучению призывного контингента, опыта организации физической подготовки в иностранных армиях.
Ученым института принадлежит приоритет в подготовке Доктрины развития физической подготовки в Вооруженных Силах, реализуемой с 1998 г. За Военным институтом физической культуры в России и Санкт-Петербурге прочно закрепилась репутация серьезной и результативной научной школы, кузницы научных кадров самой высокой квалификации. Начиная с 1997г. при Военном институте физической культуры создан и функционирует диссертационный совет по специальностям 13.00.04 - Теория и методика физического воспитания, спортивной тренировки и оздоровительной физической культуры, 13.00.08 - Теория и методика профессионального образования. Среди лиц, выполнивших работы и защитившихся в институте - представители военно-учебных заведений Москвы, Челябинска, Ростова-на-Дону, Рязани, Ульяновска, Ярославля, Новочеркасска, Вольска и других городов России.
Одно из приоритетных направлений исследований - качественное совершенствование системы подготовки офицерских кадров в самом институте. В общем числе диссертационных работ, выполненных в последние годы, удельный вес таких диссертаций имеет устойчивую тенденцию к повышению.
Целенаправленная работа по подготовке и аттестации научных кадров проводится через очную и заочную адъюнктуру и докторантуру. Вчерашние выпускники института, получив опыт службы в войсках и ввузах, поступив в адъюнктуру при институте, имеют возможности для проведения собственных исследований, могут консультироваться с маститыми учеными. Растить ученых, которые будут определять ориентиры и контуры науки в XXI в., помогает военно-научное общество слушателей и курсантов, насчитывающее 12 кружков, и 168 своих членов. В Институте есть осознание того, что для сохранения своих позиций в науке и спорте, обеспечения такого уровня подготовки специалистов, который бы соответствовал современным требованиям, необходимо принятие глубоко продуманных и последовательных мер.
В этом отношении идет работа по сохранению и укреплению кадрового потенциала, с тем чтобы не утратить ни одну крупицу бесценного опыта, чтобы не прервать преемственность традиций. В декабре 2008 г. институт успешно прошел государственную аккредитацию. Остаточные знания курсантов по таким предметам, как «социология» были подтверждены на 79%, по «философии» на 86%, а по дисциплине «русский язык» на 100%.
Реализуется комплекс мер по возвращению Института на лидирующие позиции в спорте, прежде всего, по олимпийским видам. Для этого совершенствуется система отбора в институт перспективных спортсменов, создаются для них соответствующие условия, качественно организуется учебно-тренировочный процесс.
В настоящее время в институте продолжает совершенствоваться учебно-материальная база. Имеется ввиду не только ремонт и ввод в строй новых объектов, но и техническое переоснащение, компьютеризация, обновление парка ТСО и т. п.
Институт стремится установить более тесные связи с войсками, шире учитывать современные тенденции в организации боевой учебы при подготовке будущих офицеров-специалистов по физической подготовке и спорту.
С этой целью на базе Военного института физической культуры, под эгидой Управления физической подготовки Вооруженных Сил России с 1994 г. ежегодно издается научно-теоретический журнал «Теория и практика физической подготовки», в котором обобщается передовой опыт организации и проведения физической подготовки военнослужащих всех видов, родов и ведомств.