Сегодня в Санкт-Петербургском университете гражданской авиации плодотворно функционируют 5 филиалов (в Якутске, в Хабаровске, в Выборге, в Бугуруслане и в Красноярске), два представительства (в Иркутске и Миниральных Водах), три института, одиннадцать факультетов, 36 кафедр, аспирантура и докторантура, учебно-летный отряд, НТЦ (научно технический центр, включающий НИС); тренажерный центр (ОЛШТ, ОДТ), библиотека, учебно - научный информационно-издательский центр и другие подразделения, необходимые для успешного функционирования современного вуза.
В Университете гражданской авиации по 12 специальностям и 20 специализациям обучаются 6.5 тысяч студентов (очное, заочное и вечернее обучение), в том числе более 500 иностранных граждан из 25 стран мира. Кроме того , ежемесячно до 300 человек повышают квалификацию и проходят переподготовку в системе дополнительного профессионального образования.
Университет располагает современной учебно-лабораторной, производственной и социальной базой. Решением Министерства образования РФ Санкт-Петербургский университет гражданской авиации определен базовым вузом учебно-методического объединения (УМО)по образованию в области аэронавигации, главной целью которого является координация действий научно-педагогической общественности учебных заведений, представителей предприятий, учреждений и организаций по обеспечению высокого качества высшего профессионального образования.
В соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 26 июня 2007 года №827-р к Санкт-Петербургскому государственному университету гражданской авиации присоединено (в качестве структурного подразделения)Федеральное государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования "Санкт-Петербургское авиационно-транспортное училище имени главного маршала авиации А.А.Новикова", что оформлено 20 марта 2009 года в МИФНС №15 по г. Санкт-Петербургу выдачей соответствующего свидетельства о внесении изменений в Единый государственный реестр юридических лиц. Присоединенному среднему учебному заведению, расположенному по адресу Литейный проспект, дом 48, приказом ректора Университета присвоено наименование - Авиационно-транспортный колледж.
Коллектив Университета гражданской авиации с оптимизмом смотрит в будущее и направляет свои усилия на совершенствование подготовки кадров, решение актуальных проблем гражданской авиации, повышение ее роли в экономике нашей страны.